View job here

English version below

Messkunst „Made in Germany" – dafür stehen die ca. 2100 Mitarbeitenden der Physikalisch-Technischen Bundesanstalt (PTB). Als nationales Metrologieinstitut und führende Forschungseinrichtung entwickeln wir in einem internationalen Arbeitsumfeld weltweit führende Standards für das Messen. So sorgen wir dafür, dass Menschen und Organisationen Messungen vertrauen können.

In Braunschweig suchen wir Sie für den Fachbereich 3.2 „Biochemie“ als:

 

Doktorandin / Doktorand (m/w/d) im Bereich
Computergestützte Metabolomik und Proteomik
(Bioinformatik, Computational Biology, Mathematik, Informatik)

Entgeltgruppe 13 TVöD Bund ○ befristet für 3 Jahre ○ Teilzeit 33,15 Wochenstunden

 

Ihre Aufgaben:

Die Arbeitsgruppe 3.24 „Standardisierung für „Omics“ in biomolekularen Messungen“ sucht Sie im Bereich „Computergestützte Metabolomik und Proteomik“. Sie interessieren sich für Bioinformatik, Systembiologie und Methodenentwicklung zur Standardisierung und Analyse biochemischer Messdaten? Unser Ziel ist die Entwicklung robuster, quelloffener und reproduzierbarer Werkzeuge für praxisnahe Anwendungen in der biologischen und klinischen Forschung. Die Stelle ist am Braunschweig Integrated Centre of Systems Biology (BRICS) auf dem Campus der TU Braunschweig angesiedelt. Sie unterstützen uns mit folgenden Tätigkeiten:

  • Entwicklung, Implementierung und Evaluation mathematischer Methoden zur Quantifizierung von Messunsicherheiten in hochdimensionalen, massenspektrometriebasierten Omics-Daten, insbesondere Proteomik-Daten
  • Zusammenarbeit mit experimentellen und klinischen Forschenden zur Validierung der Berechnungswerkzeuge und -methoden
  • Beitrag zu Open-Source-Softwareprojekten und Community-Standards im Bereich der Omics-Datenanalyse
  • Publikation und Präsentation der wissenschaftlichen Ergebnisse

 

Ihr Profil:

  • Abgeschlossenes Hochschulstudium (Diplom/Master) der Fachrichtung Bioinformatik, Computational Biology, Mathematik, Informatik oder vergleichbar
  • Nachgewiesene Programmiererfahrung in R, Python oder ähnlichen Sprachen (z. B. via GitHub-Projekte, veröffentlichte Pipelines oder Analyseskripte)
  • Kenntnisse und Erfahrungen auf folgenden Gebieten sind von Vorteil:
    • Bioconductor, tidyverse und quarto
    • Massenspektrometriebasierte Metabolomik/Proteomik oder Omics-Datenanalyse
    • Statistische Modellierung, Maschinelles Lernen und geometrischen/topologischen Methoden der Datenanalyse
    • Reproduzierbare Wissenschaft, Open-Source-Entwicklung und FAIR-Datenprinzipien
  • Kooperative, strukturierte, zielorientierte und proaktive Arbeitsweise
  • Ausgeprägte Team- und Kommunikationsfähigkeit
  • Deutsch- (B1-Niveau) und Englischkenntnisse (C1-Niveau)
  • Bereitschaft zu Dienstreisen im In- und Ausland

 

Wir bieten:

  • Exzellentes Umfeld: Sie arbeiten an der Spitze der computergestützten Omics-Forschung in einem kooperativen und unterstützenden Umfeld. Führen Sie Ihre Forschung an der PTB und der TU Braunschweig durch, zwei führenden Institutionen, die eine hervorragende Infrastruktur und wissenschaftliche Netzwerke bieten. Nutzen Sie modernste Forschungseinrichtungen, umfangreiche Datensätze und Hochleistungsrechner.
  • Promotionsbetreuung: Sie forschen in einem international renommierten Team und profitieren von hervorragender Infrastruktur. Sie erhalten exzellente Betreuung und Schulungen sowohl in technischer Hinsicht als auch für Softskills. Bei uns können Sie sich vollkommen auf Ihre Promotion fokussieren und müssen keine Lehre übernehmen. Sie haben die Möglichkeit, sich national und international zu vernetzen, u. a. auf wissenschaftlichen Konferenzen und Workshops.
  • Work-Life-Integration: Wir bieten flexible Arbeitszeitgestaltung und -bedingungen (Teilzeit, Gleitzeit, Homeoffice, Telearbeit, Gleittage) zur Vereinbarkeit von Familie, Pflege und Beruf in jeder Lebensphase.
  • Transparente Konditionen: Entgelt nach TVöD Bund, 30 Tage Urlaub, eine Betriebsrente für Tarifbeschäftigte sind einige der Vorteile bei uns.
  • Standortvorteil: Der attraktive Campus mit unkomplizierter Verkehrsanbindung ist auch sehr gut mit direkter Busverbindung zu erreichen.
  • Jobticket: Der Schutz von Umwelt und Klima ist uns wichtig. Für Ihren Weg zur Arbeit mit öffentlichen Verkehrsmitteln bieten wir das Deutschlandticket an und übernehmen einen Teil der Kosten.
  • Familienorientierung: Ob Kita, Eltern-Kind-Büros oder Betreuung während der Ferienzeit: Wir haben verschiedene Angebote, die dabei helfen, den Spagat zwischen Familie und Beruf zu meistern.
  • Inklusion: Für Menschen mit Behinderung bieten wir eine inklusive Unternehmenskultur sowie integrative Maßnahmen.
  • Weiterbildungsmöglichkeiten: Wir wollen Sie weiterbringen und ermöglichen im Rahmen der Kompetenzerweiterung zahlreiche Aus- und Weiterbildungsmöglichkeiten.
  • Gesundheitsangebote: Ihre Gesundheit liegt uns am Herzen, daher bieten wir gesundheitsfördernde und -erhaltende Maßnahmen wie Betriebssport, mobile Massage und Rückenkurse.
  • Mensa: Das kulinarische Angebot der Universitätsmensa, die auf dem TU-Campus liegt, bietet jeden Tag vielfältige Gerichte – auch vegetarisch/vegan

 

Das ist uns wichtig:

Die PTB fördert die Gleichstellung von Frauen und Männern und ist besonders an Bewerbungen von Frauen interessiert. Gleichzeitig sind wir bestrebt, die gesellschaftliche Vielfalt widerzuspiegeln. Daher ist jede Bewerbung, unabhängig von ihrem Geschlecht, ihrer kulturellen oder sozialen Herkunft, Religion, Weltanschauung oder sexuellen Identität herzlich willkommen. Schwerbehinderte oder ihnen gleichgestellte Menschen werden bei gleicher Eignung bevorzugt berücksichtigt.

 

Ihre Bewerbung:

Fachliche Fragen zu dieser Position beantworten Ihnen im Fachbereich 3.2: 
Prof. Dr. Thomas Naake, Tel.: 0531 592-3240, E-Mail: thomas.naake@ptb.de.

Wir freuen uns auf Ihre Bewerbung bis zum 25. Juni 2026 unter der Kennziffer 26-91-3B. Bitte nutzen Sie dafür den Button „ONLINE BEWERBEN“ – dieser führt Sie direkt zu unserem Bewerbungsportal, wo Sie Ihre Unterlagen (Lebenslauf, Zeugnisse, Anschreiben) hochladen können. Bewerbungen per E-Mail können wir nicht berücksichtigen. Mit Ihrer Bewerbung akzeptieren Sie die Datenschutzbestimmungen.

 

English version:

The art of measurement — made in Germany. Striving to perfect it is the mission of the 2,100 employees of PTB, the Physikalisch-Technische Bundesanstalt. As Germany’s national metrology institute and a leading center of research, we operate in an international environment to develop world-class measurement standards. We at PTB work to ensure that people and organizations can trust the measurements they use.

 

At our Braunschweig site, we are looking to fill the following position in Department 3.2 (Biochemistry):

 

Doctoral candidate
in the field of computational metabolomics and proteomics
(bioinformatics, computational biology, mathematics, computer science)

Remuneration Group 13 TVöD Bund ○ Three-year fixed term ○ Part-time (33.15 hours/week)

 

Your tasks:

The working group 3.24 "Standardisation for "Omics" in Biomolecular Measurements" is looking for you in the field of "Computational Metabolomics and Proteomics". Are you interested in bioinformatics, systems biology and method development for the standardisation and analysis of biochemical measurement data? Our aim is to develop robust, open-source and reproducible tools for practical applications in biological and clinical research. The position is located at the Braunschweig Integrated Centre of Systems Biology (BRICS) on the campus of the TU Braunschweig. 
Your activities will include:

  • Development, implementation and evaluation of mathematical methods for the quantification of measurement uncertainties in high-dimensional, mass spectrometry-based omics data, especially proteomics data
  • Collaboration with experimental and clinical researchers to validate the computational tools and methods
  • Contribution to open-source software projects and community standards in the field of omics data analysis
  • Publication and presentation of scientific results

 

Your profile:

  • Completed university degree (diploma/master) in bioinformatics, computational biology, mathematics, computer science or comparable
  • Proven programming experience in R, Python or similar languages (e.g. via GitHub projects, published pipelines or analysis scripts)
  • Knowledge and experience in the following fields is an advantage:
  • Bioconductor, tidyverse and quarto
  • Mass spectrometry-based metabolomics/proteomics or omics data analysis
  • Statistical modelling, machine learning and geometric/topological methods of data analysis
  • Reproducible science, open-source development and FAIR data principles
  • Cooperative, structured, goal-oriented and proactive way of working
  • You are a strong team player with excellent communication skills
  • You have achieved B1 level in German an C1 level in English
  • You are willing to travel for work both in Germany and abroad

 

We offer:

  • Excellent environment: you will work at the forefront of computational omics research in a collaborative and supportive environment. Conduct your research at PTB and TU Braunschweig, two leading institutions offering excellent infrastructure and scientific networks. Utilise state-of-the-art research facilities, extensive data sets and high-performance computers.
  • Doctoral supervision: You will conduct research in an internationally renowned team and benefit from an outstanding infrastructure. You will receive excellent supervision and training in both technical and soft skills. With us, you can focus entirely on your doctorate and do not have to take on any teaching. You will have the opportunity to network nationally and internationally, for example at scientific conferences and workshops.
  • Work-life integration: We offer flexible working hours and conditions (part-time, flexitime, home office, teleworking, flexdays) to help you balance family, care and career at every stage of your life.
  • Transparent conditions: Remuneration according to TVöD Bund, 30 days' holiday, a company pension for tariff employees are some of the benefits with us.
  • Location advantage: The attractive campus with uncomplicated transport links is also very easy to reach by direct bus. Job ticket: Protecting the environment and climate is important to us. For your journey to work by public transport, we offer the Deutschlandticket and cover part of the costs. Family orientation: Whether it's a daycare centre, parent-child offices or childcare during the holidays, we have a range of services to help you manage the balancing act between family and career.
  • Inclusion: We offer an inclusive corporate culture and integrative measures for people with disabilities.
  • Further training opportunities: We want to help you progress and provide numerous training and development opportunities as part of our skills development programme.
  • Health programmes: Your health is important to us, which is why we offer health-promoting and health-maintaining measures such as company sports, mobile massage and back courses.
  • Canteen: The university canteen, which is located on the TU campus, offers a variety of dishes every day - including vegetarian/vegan options

 

This is important to us:

PTB promotes gender equality and strongly encourages applications from female candidates. At the same time, we strive to reflect the diversity of our society. We therefore welcome every application submitted, regardless of the candidate’s gender, cultural or social background, religion, ideology or sexual identity. If equally suited to the position, disabled persons or persons having equivalent status under German law will be given preference.

 

Your application:
For subject-related questions concerning this position, please contact Department 3.2:
Prof. Dr. Thomas Naake, phone: +49 531 592-3240, email: thomas.naake@ptb.de.

We look forward to receiving your application by 25 June 2026 under Ref. No. 26-91-3B. Please click on the following button: ONLINE BEWERBEN. This will directly lead you to our application portal where you can upload your documents (CV, certificates, Cover letter). Unfortunately, we cannot accept applications sent via email. With your application you accept the data protection regulations.